轉錄和**表型分析揭示結直腸癌

在結直腸癌(CRC)的發展中，腺瘤-癌序列的范例通常集中在癌細胞上；然而，現在清楚的是，癌癥進展涉及轉化細胞與其周圍微環境之間的異源相互作用。到目前為止，大多數研究都依賴于結直腸癌晚期的批量圖譜來識別癌癥驅動基因并定義與癌癥相關的生物學過程。

近日，來自萊頓大學醫學院病理學系的研究者們在Gut雜志上發表了題為“Transcriptomic and immunophenotypic profiling reveals molecular and immunological hallmarks of colorectal cancer tumourigenesis”的文章，該研究揭示了早期結直腸癌腫瘤發生的分子和**學景觀。研究者確定了與**進展密切相關的生物標志物，以及可在臨床環境中利用的有針對性的**過程。

對結直腸癌(CRC)的逐步發展和進展的生物學洞察對于開發針對這種**的早期發現和*佳臨床處理的量身定制的方法是必不可少的。在本研究中，研究者的目標是剖析伴隨著結直腸癌惡變的轉錄和**學改變，并通過對PT1結直腸癌樣本的空間圖譜來識別臨床相關的生物標記物。

研究者在8個PT1癌組織上使用數字空間圖譜(GeoMx)來研究不同組織學區域的上皮和間質節段的基因表達，包括正常黏膜、低度和高度不典型增生和癌。連續的組織切片通過成像質量細胞儀進行分析，以揭示**環境。*后，對公開獲得的單細胞RNA測序數據進行分析，以確定相關轉錄本的細胞來源。

對PT1結直腸癌樣本中不同區域的基因表達的比較發現，在不同的組織結構中，差異表達的基因在上皮(n=1394個基因)和間質段(n=1145個基因)中。通路分析發現，在惡性轉化過程中，炎癥反應較早發生，典型的表現為基因信號上調，如先天**感應。

研究者檢測到骨髓細胞浸潤增加，巨噬細胞通過發育**從正常組織向癌癥轉移，從親炎癥的HLA- DR+CD204 -巨噬細胞向HLA- DR - CD204+**抑制亞群轉移，同時CD47/ SIRPα“不吃我信號”上調。

總之，這項研究展示了數字空間剖面圖在早期結直腸癌中的應用，并對伴隨結直腸癌逐步進展的生物學過程提供了見解。本研究的結果表明先天**在結直腸癌發病中起著重要作用。此外，該研究的方法提供了一個框架，用于識別在結直腸癌發生過程中持續變化的生物標記物。這些見解為改善早期結直腸癌患者的臨床管理鋪平了道路。（生物谷 Bioon.com）